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Projets de recherche financés par le département des programmes de recherche de la DGO6

CHICOPAT

CHICOPAT : Etude de la résistance aux maladies foliaires chez la chicorée industrielle et développement d'outils pour la sélection assistée par marqueurs moléculaires

Montant de la subvention : 184 000 €

Durée de la recherche : 24 mois

Programme : FIRST Post-Doc

Résumé :

La chicorée industrielle est une espèce bisannuelle sélectionnée en Belgique depuis une vingtaine d'années pour la production d'inuline, un polymère de fructose utilisé dans l'industrie agro-alimentaire en tant qu'agent de texture ou en tant qu'édulcorant basse calorie. La découverte de l'impact positif de la consommation d'inuline sur le développement de la flore intestinale, sur la régulation des taux de glucose sanguin, sur l'absorption du calcium et sur la diminution des risques de cancer du colon a créé de nouveaux débouchés pour l'inuline dans le secteur pharmaceutique et dans le domaine des alicaments ou « aliments santé ».

L'intensification de la sélection variétale et de la culture de la chicorée en Wallonie ces dernières années est allée de paire avec l'apparition de plus en plus fréquente de sensibilités aux maladies foliaires. Chez la chicorée industrielle, les principales maladies foliaires susceptibles d'affecter les rendements sont l'oïdium et la rouille et dans une moindre mesure Pseudomonas et Alternaria.

Bien que ces problèmes soient jusqu'à présent marginaux, ils tendent à se répandre et pourraient constituer à terme, si rien n'était fait, un réel problème. C'est dans ce contexte qu'une action concertée des sélectionneurs et de la recherche scientifique a été envisagée. Au cours du projet CHICOPAT, on cherchera à mettre en évidence les voies de réponses aux attaques pathogènes effectivement activées chez la chicorée industrielle par une approche d'analyse transcriptomique menée à l'échelle du génome entier. Ces résultats permettront de focaliser la recherche sur des gènes différentiellement exprimés suite à l'attaque par des pathogènes et/ou entre cultivars dits « sensibles » ou « résistants ».

Par la suite, une recherche de polymorphisme sera entreprise pour ces gènes afin de tenter de mettre en évidence du polymorphisme associé à la sensibilité ou à la résistance, celui-ci pouvant servir à terme au développement de marqueurs de sélection prédictifs. Au terme de cette convention, l'objectif est de pouvoir fournir au sélectionneur un outil efficace et convivial lui permettant, en complément de la sélection classique, d'orienter la sélection vers des lignées ou cultivars plus résistants aux maladies foliaires. Outre l'impact direct pour le sélectionneur qui verra augmenter la compétitivité de ses semences sur le marché, cette démarche s'inscrit dans le développement durable de la culture de la chicorée industrielle, la réduction des besoins en traitements phytosanitaires et l'augmentation de la profitabilité pour l'ensemble de la filière chicorée (agriculteurs, sélectionneurs, industries transformatrices).

Promoteur

Université de Namur - UMDB - UMDB-Unité de Méthodologie et de Didactique
Rue de Bruxelles, 61 à 5000 NAMUR | tél +32 81 72 44 14 | fax +32 81 72 43 82 |  | http://www.unamur.be/sciences/biologie/umdb/membres

Candidat

Université de Namur - UMDB - UMDB-Unité de Méthodologie et de Didactique
Rue de Bruxelles, 61 à 5000 NAMUR | tél +32 81 72 44 14 | fax +32 81 72 43 82 |  | http://www.unamur.be/sciences/biologie/umdb/membres

Partenaire industriel

Cosucra Groupe Warcoing SA division CHICOLINE
Rue de la Sucrerie, 2 à 7740 WARCOING | tél +32 69 55 32 11 | fax +32 69 55 32 77 |  | http://www.cosucra.com

Domaines Technologiques

  • Biotechnologie
  • Phytotechnie, horticulture, protection des cultures et des récoltes, phytopathologie

Mots-Clés

  • Chicorée
  • Résistance
  • Pathogène
  • Oïdium
  • Rouille
  • Transcriptomique
  • Sélection

Année de publication : 2009

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